فلج مغزی تشخیص کلینیکی است که بر پایه ی معاینه دقیق سیستم عصبی داده می شود. مانند سایر بیماری ها، شرح حال دقیق در مورد سوابق مادر، مشکلات قبل و حین بارداری و زایمان و سوابق رشدی مهم است. معاینه دقیق سیستم عصبی و معاینه در وضعیت های مختلف خوابیدن به پشت و شکم، ایستادن، راه رفتن و دویدن مهم است. تشخیص فلج مغزی در زیر شش ماهگی مگر در موارد شدید امکان پذیر نیست. اولین نشانه های آن تاخیر در رشد و تکامل (تاخیر در کنترل سر و گردن و نیز عدم توانایی جهت نشستن) و اختلال تون عضلانی است.